Forestil dig at vågne til en verden, hvor hvert eneste menneske på mystisk vis er blevet forvandlet til sten...
En skæbnesvanger dag blev hele menneskeheden til sten. Mange årtusinder senere befrier Taiju sig fra forsteningen og befinder sig omgivet af statuer. Situationen ser dyster ud - indtil han støder på sin videnskabselskende ven Senku! Sammen planlægger de at genstarte civilisationen med videnskabens kraft!
Senku og Dr. Xeno er Stenverdenens to bedste videnskabsmænd, og nu slår de sig sammen i deres søgen efter oprindelsen af petristrålen, der zappede hele menneskeheden. Men vejen til, hvor det hele startede, viser sig at være ujævn! Kan besætningen krydse naturen for at komme dybt ind i Sydamerika, alt imens de undviger den voldsomt stædige Stanley?