Forestil dig at vågne til en verden, hvor hvert eneste menneske på mystisk vis er blevet forvandlet til sten...
En skæbnesvanger dag blev hele menneskeheden til sten. Mange årtusinder senere befrier Taiju sig fra forsteningen og befinder sig omgivet af statuer. Situationen ser dyster ud - indtil han støder på sin videnskabselskende ven Senku! Sammen planlægger de at genstarte civilisationen med videnskabens kraft!
Senku er tilbage i aktion, og hans genoplivning fører til Videnskabsrigets triumferende tilbagevenden. Processen har dog afsløret en opsigtsvækkende hemmelighed om forsteningsfænomenet - en, der repræsenterer en forbudt frugt for menneskeheden! I mellemtiden er missionen for at nå månen på vej op i et projekt af global skala!