Naruto var en ung shinobi med en uforbederlig evne til fortræd. Han opnåede sin drøm om at blive den største ninja i sin landsby, og nu sidder hans ansigt på toppen af Hokage-monumentet.
Men dette er ikke hans historie... En ny generation af ninjaer er klar til at indtage scenen, ledet af Narutos egen søn, Boruto! Der er gået årevis siden Naruto og Sasuke slog sig sammen for at besejre Kaguya, chakraets stamfader og den største trussel, som ninjaverdenen nogensinde har stået overfor. Tiderne er nu fredelige, og den nye generation af shinobi har ikke oplevet de samme strabadser som deres forældre. Måske er det derfor, Boruto hellere vil spille videospil end træne.
En lidenskab brænder dog dybt i denne ninja-dreng, og det er at besejre sin forsømmelige far!